Séquençage HA et NA (Sanger ou NGS)

Last updated on 7-2-2024 by Amber Van Laer

Description du test 

Séquençage des virus Influenza A ou B (Hémagglutinine & Neuraminidase).

But du test

Déterminer la séquence des virus (dérive antigénique, mutations, résistance,.. ).

Critères pour effectuer ce test dans le cadre des activités de référence

Effectués uniquement sur des prélèvements iInfluenza positifs dans les cas de: 

  • Infection respiratoire sévère aigüe (SARI) avec ARDS, ECMO ou décès
  • Syndrome grippal après vaccination contre la grippe
  • Suspicion résistance aux antiviraux  
  • Syndrome grippal max 2 semaines après retour de l’étranger
  • Surveillance 

Instructions sur l’échantillon

Types d’échantillons: 

  • frottis nasopharyngés, 
  • aspirations bronchiques, 
  • lavages bronchoalvéolaires.

Dans tube stérile avec VTM (virus transport medium).

Volume minimal : 500µl.

Stockage:
Maximum 24 heures à 2-8°C. 

Si le stockage dure plus de 24 heures, conserver à -20°C ou -70°C.

Instructions sur le transport

Les spécimens conservés à 2°C-8°C peuvent être envoyés à température ambiante. 

Les spécimens conservés à -20°C ou -70°C doivent être envoyés sur de la carboglace.

Le temps de transport doit rester le plus court possible (éviter les transports pendant le week-end et les jours fériés).

Acheminement dans un triple emballage à température ambiante ou réfrigéré. Le récipient doit être fermé hermétiquement.

Demandes non acceptées

L’analyse ne sera pas effectuée en cas de :

  • Échantillon inapproprié ou insuffisant
  • Stockage ou transport incorrect
  • Formulaire de demande non rempli
  • Demande ne répondant pas aux critères 

Les échantillons seront conservés maximum 1 an pour un nouveau test (eg re-test), si assez d’échantillon est disponible

Communication des résultats des tests

Le rapport est envoyé par l’intermédiaire du LIMS (email, fax ou courrier).

Pathogen info

Pathogen(s): 
Influenza virus

Accréditation

Is the analysis accredited?

Materials and methods

Method reference: 
-

Turnaround time and time slots

Turnaround time: 
30 days

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Analysis categories

Medical

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