Opsporen van STEC-uitscheidende runderen aan de hand van Droplet Digital PCR: Een detectie met duizenden druppels.

De darmbacterie Escherichia coli is een over het algemeen onschadelijke bacterie die deel uitmaakt van de gezonde darmflora bij mens en dier. Toch kunnen enkele types E. coli, zoals de Shiga-toxine producerende E. coli of STEC, milde tot zeer ernstige ziektes veroorzaken bij de mens. Het vermogen van deze bacterie om Shiga-toxines als specifieke gifstoffen te produceren kan leiden tot diarree, bloedstollingstoornissen en nierfalen met soms de dood tot gevolg, vooral bij jonge kinderen en ouderen (1). Herkauwers en vooral runderen worden beschouwd als het belangrijkste reservoir van STEC. Terwijl deze dieren zelf zelden of nooit ziektetekens vertonen, liggen ze vaak aan de basis van STEC uitbraken bij de mens door direct contact met de besmette dieren of door voeding gecontamineerd met STEC. Hoe STEC zich weet te onderhouden binnen de runderpopulatie is echter nog niet volledig duidelijk. Geïnfecteerde dieren kunnen opgespoord worden door STEC-aanwezigheid te bepalen in mest. Sommige runderen scheiden opmerkelijk hoge aantallen STEC uit. Deze worden “super-shedders” genoemd en spelen waarschijnlijk een cruciale rol in het onderhouden van STEC infecties in de runderpopulatie (2). Het bepalen van de uitgescheiden hoeveelheden STEC in mest kan veel duidelijkheid scheppen omtrent de overdracht van STEC, de contaminatiebronnen en de effectiviteit van bepaalde behandelingen op hoeveniveau.