Flavivirus PCR

Description du test

RT-PCR en temps réel pour la détection de l’ARN viral des flavivirus (genre Flavivirus), notamment le virus de la dengue, le virus du Nil occidental, le virus de l’encéphalite à tiques, le virus de l’encéphalite japonaise, le virus de la fièvre jaune, le virus Zika, le virus Usutu, le virus de l’encéphalite de Saint-Louis et le virus de l’encéphalite verno-estivale russe. L’identification de l’espèce se fait par séquençage ou par RT-PCR spécifiques.

But du test

Diagnostic pendant la phase aiguë de la maladie (jusqu’à 7 jours après l’apparition de la maladie).

Critères pour effectuer ce test

• Suspicion clinique d’une infection récente (jusqu’à 7 jours après l’apparition de la maladie).
• L’intervalle entre l’apparition des symptômes et le prélèvement de l’échantillon doit être mentionné sur le formulaire de demande.
• Les données cliniques et épidémiologiques doivent être fournies sur le formulaire de demande.

Instructions pour l’échantillon

• Sérum/plasma, ou LCR
• Volume minimum sérum/plasma : 1 ml
• Volume minimum LCR : 350 µl
• Pour des concentrations stables d’ARN, le sérum doit être immédiatement séparé des cellules sanguines et stocké à une température de 4°C.
• Si le transport au CNR se fait après plus de 24 h, les échantillons doivent être stockés et envoyés à une température de -20°C.

Instructions pour le transport

• Les spécimens conservés à 4°C peuvent être envoyés à température ambiante.
• Les spécimens conservés à -20°C doivent être envoyés sur de la carboglace.
• Le temps de transport doit rester le plus court possible (éviter les transports pendant le week-end et les jours fériés).

Demandes non acceptées

L’analyse ne sera pas effectuée si :

• l’échantillonnage a été fait en dehors de la phase aiguë de la maladie (ou si date du début des symptômes n’est pas mentionnée) ;
• l’échantillon est inapproprié ou insuffisant ;
• le stockage ou le transport a été inadapté ;
• si le formulaire de demande n’a pas été complètement rempli.

Délai pour recevoir le résultat d’analyse (et fréquence d’analyse)

7 jours en moyenne.

Contacter le laboratoire si un diagnostic urgent est nécessaire.

Communication des résultats des tests

Le rapport sera envoyé par fax, par courrier ou par e-mail.