WGS - MultiLocus Sequence Typing (WGS-MLST)

Last updated on 9-10-2024 by Amber Van Laer

Description du test

  • Typage moléculaire des entérocoques par séquençage du génome entier (WGS) des entérocoques. Le type MLST est déterminé sur la base des séquences obtenues.
  • La caractérisation en profondeur est effectuée à l’aide du génome central en combinaison avec des données épidémiologiques.

Objectif du test WGS

Détermination du type de séquence et de la parenté clonale

Critères de réalisation de WGS

  • Voir identification des entérocoques
  • Plus d’une souche doit être disponible et la suspicion d’épidémie n’est possible qu’après contact avec le centre de référence (referentiecentrum@uza.be).
  • Échantillons appropriés
  • Culture pure sur plaque avec colonies individuelles

Instructions pour le transport

Voir identification des entérocoques

Applications inacceptables

  • Pas de culture de réincorporation
  • Formulaire de demande incomplet

Délai d’exécution et fréquence des analyses

  • Fréquence d’analyse : par série complète, sauf en cas d’épidémie (contacter le CNR en cas d’épidémie)
  • Délai d’exécution : contacter le centre de référence

Communication des résultats des tests

  • Comment : par télécopie
  • Quand : lorsque le résultat complet de l’analyse est connu

Accréditation

Is the analysis accredited?

Materials and methods

Material(s): 
Method reference: 
-

Request forms

Analysis categories

Medical

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