Identification

Description

Sur les colonies isolées d’une sous-culture fraîche, détermination du profil des protéines ribosomales par spectrométrie de masse MALDI-TOF et analyse par comparaison à une base de données aboutissant au nom de genre et d’espèce de la souche étudiée.

But du test

Critères pour effectuer ce test

• Toute souche de vibrion isolée d’un patient présentant les symptômes d’une infection à Vibrio cholerae.
• Toute souche de vibrion isolée d’un patient présentant les symptômes d’une infection à Vibrio parahaemolyticus.
• Toute souche de Vibrio cholerae identifié ou probable envoyée pour confirmation.
• Toute souche de Vibrio parahaemolyticus ou de Vibrio non cholerae envoyée pour identification / confirmation de l’espèce.
• Ensemble de souches de Vibrio cholerae isolées de divers prélèvements pendant une suspicion d’épidémie et envoyées après un contact avec le CNR.

Instructions sur l’échantillon

Instruction sur le transport

• La souche doit être conditionnée dans un milieu de transport adapté (boîte ou tube gélosé, écouvillon avec milieu de transport) et correctement identifiée.
• Acheminement dans un triple emballage :
  • Boîtes et tubes bien fermés hermétiquement ;
  • Emballage avec un matériel adsorbant dans un emballage secondaire (étui de type blister de transport, containers etc.) ;
  • Le tout ensuite placé dans une enveloppe matelassée ou une boîte.
• Aussi rapidement que possible à T° ambiante, dans les 72 heures après la préparation.
• Etiquetage et conditions de transport conformes à la règlementation en vigueur concernant les matières infectieuses.
• Pour chaque souche, le formulaire de demande (téléchargeable sur le site des CNR de Sciensano) doit obligatoirement être rempli avec le plus de précisions possibles et joint à chaque souche envoyée.

Demande inacceptable

• échantillon non identifié,
• formulaire de demande incomplet,
• conditions évidentes de conservation ou de transport inappropriées.

Délai pour recevoir le résultat d’analyse

• Fréquence d’analyse : à la demande.
• Délai pour une identification: 48 heures.
• Jours d’analyse : tous les jours ouvrables du lundi au vendredi.

Communication des résultats des tests

• Comment : communication téléphonique (1) et compte-rendu papier par la poste (2) ou compterendu électronique (3).
• Quand : lorsque des résultats pertinents d’analyses (même partiels) sont connus (téléphone, email :1 ou 3), lorsque tous les résultats d’analyses sont connus (rapport écrit : 2 ou 3)