PCR - Gènes codant pour la toxine CtxA de Vibrio cholerae

Last updated on 21-11-2024 by Amber Van Laer

Description

Les sérogroupes pathogènes produisent la toxine cholérique, alors que les souches non pathogènes peuvent ou non produire cette toxine.

Le bactériophage filamenteux Ctx confère aux souches de Vibrion cholerae (V. cholerae), l’opéron Ctx, portant les gènes CtxA et CtxB. La transmission se fait par un transfert horizontal, avec intégration de l’opéron dans le génome bactérien qui est alors capable de produire la toxine cholérique conférant une pathogénicité à la bactérie. Cette toxine cholérique sera notamment responsable de symptômes diarrhéiques pouvant mettre en péril le pronostic vital. Dans le cadre des activités du centre national de référence, une PCR en temps réel a été développée pour détecter les souches de V. cholerae virulentes (responsables du choléra) en ciblant une portion de l’opéron Ctx (gène CtxA).
Amplification de gènes ‘CtxA’ par PCR en temps réel.

But du test

Détection de la toxine cholérique, facteur de virulence des V.cholerae.

Critères pour effectuer ce test

Toute souche de Vibrio reçue et confirmée V.cholerae par le CNR et isolée de prélèvements humains.

Instructions sur l’échantillon

A partir d’une culture de la souche de V.cholerae à envoyer, préparation d’une sous-culture fraîche et pure sur un milieu nutritif et envoi soit sur la gelose en boîte, soit après inoculation massive en profondeur dans une gélose nutritive en tube, soit sur écouvillon dans son milieu de transport après avoir récolté la sous-culture.

Instruction sur le transport

  • La souche doit être conditionnée dans un milieu de transport adapté (boîte ou tube gélosé, écouvillon avec milieu de transport) et correctement identifiée.
  • Acheminement dans un triple emballage :
    • Boîtes et tubes bien fermés hermétiquement ;
    • Emballage avec un matériel adsorbant dans un emballage secondaire (étui de type blister de transport, containers, etc.) ;
    • Le tout ensuite placé dans une enveloppe matelassée ou une boîte.
  • Aussi rapidement que possible à T° ambiante, dans les 72 heures après la préparation.
  • Etiquetage et conditions de transport conformes à la règlementation en vigueur concernant les matières infectieuses.
  • Pour chaque souche, le formulaire de demande (téléchargeable sur le site des CNR de Sciensano) doit obligatoirement être rempli avec le plus de précisions possibles et joint à chaque souche envoyée.

Demande inacceptable

Les critères suivants serviront à rejeter un échantillon :
  • échantillon non identifié,
  • formulaire de demande incomplet,
  • conditions évidentes de conservation ou de transport inappropriées,
  • identification de V.cholerae non confirmée.

Délai pour recevoir le résultat d’analyse

  • Fréquence d’analyse : à la demande.
  • Délai la détection : 48 heures.
  • Jours d’analyse : tous les jours ouvrables du lundi au vendredi.

Communication des résultats des tests

  • Comment : communication téléphonique (1) et compte-rendu papier par la poste (2) ou compterendu électronique (3).
  • Quand : lorsque des résultats pertinents d’analyses (même partiels) sont connus (téléphone, email : 1 ou 3), lorsque tous les résultats d’analyses sont connus (rapport écrit: 2 ou 3)
  • Résumé de tous les résultats disponibles dans le rapport annuel.
 

Accréditation

Is the analysis accredited?

Materials and methods

Material(s): 
Method reference: 
-

Turnaround time and time slots

Turnaround time: 
2 days

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Analysis categories

Medical

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