Description du test
Typage systématique des souches STEC
Tant les souches cultivées au CNR que celles des laboratoires externes seront immédiatement caractérisées pour les paramètres suivants:
Sérogroupage O, pour les types les plus fréquents ou importants : O157, O26, O104 (si le(s) gènes aaiC et/ou aggR sont positif(s)), O103, O111, et O145.
Gènes de virulence qui sont corrélés avec une augmentation du risque de développement du SHU :
- eaeA: intimine
- sous-types stx2a et stx2d
- gènes entéroagrégatifs aaiC et aggR, qui ne sont testés en première ligne que pour les souches stx2-positives et eaeA-negatives
Typage IS629 des STEC O157: une technique moléculaire pour détecter rapidement les épidémies causées par ce sérotype.
Typage IS621 des isolats de STEC O26: seulement sur demande spéciale lors de suspicions d’épidémies (pas rapporté en routine).
Classification des souches STEC en fonction du risque de développer un SHU
Indépendamment des risques liés au patient (principalement un âge < 12 ans ou > 75 ans), le risque de développer le SHU avec la souche typée est évalué comme suit :
Risque de développer un SHU |
(Sous-)type de Shiga toxine (stx)* |
|
Elevé |
Souches positives pour stx2a ou stx2d |
|
Intermediaire |
Souches positives pour d’autres sous-types de stx2 sauf stx2f (avec ou sans stx1) |
|
Bas |
Souches positives pour stx1 (sans stx2) Souches positives pour stx2f** |
**En Europe et donc également en Belgique, une proportion importante de souches STEC sont positives pour stx2f (ECDC, Annual Epidemiological Report for 2021). Cependant, les souches positives pour stx2f ont rarement été isolées chez des patients atteints de SHU (De Rauw et al., 2019; Cointe et al., 2020) et sont principalement associées à de légers symptômes gastro-intestinaux (Van Hoek et al., 2023). Par conséquent, les souches positives pour stx2f sont rapportées dans la catégorie à bas risque de développer un SHU.
But du test
Sur base de ces tests, nous pouvons classifier le risque de développer un SHU et détecter rapidement les épidémies.
Critères pour réaliser ce test dans le cadre des activités de référence
L’analyse de toutes les souches positives pour un gène de Shiga toxine sera réalisée.
Instructions relatives aux échantillons
Voir détection et confirmation de STEC dans les selles
Instructions relatives au transport
Voir détection et confirmation de STEC dans les selles
Demandes non acceptées
Pas d’application
Délai pour recevoir le résultat des tests)
Selon les résultats, l’analyse peut durer de 3 à 10 jours.
Communication des résultats des tests
- Par courrier pour les résultats complémentaires d’échantillons positifs
- Par Medibridge pour les laboratoires et les cliniciens demandeurs qui ont un lien avec l’UZ Brussel
