BY-COVID - Beyond-COVID

Last updated on 17-8-2023 by Marie Malingreau
Durée du projet :
octobre 1, 2021
-
septembre 30, 2024

En bref

BY-COVID est un projet qui mobilise et relie les données sur la COVID-19 de la Plateforme de données sur la COVID-19 afin de les rendre plus accessibles aux laboratoires scientifiques, aux chercheurs en santé publique, au personnel médical, aux agents gouvernementaux et aux décideurs politiques. Il offre ensuite un cadre permettant de rendre ouvertes et accessibles à tous les données relatives à d’autres maladies infectieuses. C’est un projet unique de par sa démarche réellement interdisciplinaire, qui réunit 53 partenaires de 19 pays européens. 

Description du projet

À la suite à la pandémie de COVID-19, une grande quantité de données a été générée dans différents pays par de nombreux instituts, allant d’hôpitaux et de centres médicaux à des universités, des infrastructures de recherche, des laboratoires de santé publique et des consortiums. Comme ces données proviennent de nombreuses sources différentes, il reste difficile de déterminer les meilleures sources, de rapprocher les données et d’en faire la synthèse pour les analyser efficacement. 

Pour résoudre ce problème, le projet BY-COVID entend rendre les données ouvertes globales sur le SARS CoV-2 accessibles à tous les acteurs des domaines scientifique, médical, de la santé publique et de la politique au sein de la Plateforme de données sur la COVID-19. Au-delà de la COVID-19, ce projet offre également un cadre permettant de rendre ouvertes et accessibles à tous les données relatives à d’autres maladies infectieuses. Réunissant des parties prenantes d’une vaste palette de disciplines, ce projet a pour ambition de créer un pont entre la santé publique, les sciences cliniques, les sciences sociales et les sciences moléculaires.

Pour y parvenir, le projet BY-COVID a comme objectifs :

  1. de permettre le stockage, le partage, l’accès, l’analyse et le traitement des données et d’autres objets numériques de recherche issus de la recherche sur les épidémies.
  2. de mobiliser et d’exposer les données sur les virus et les maladies infectieuses humaines provenant de centres nationaux.
  3. de rapprocher les données et métadonnées sur le SARS-CoV-2 et la COVID-19 répondant au principe FAIR (faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables).
  4. d’élaborer des outils numériques et des analyses de données pour la préparation aux pandémies et aux épidémies, avec notamment le suivi des variations génomiques du SARS-CoV-2 et l’identification de nouveaux variants préoccupants.
  5. de contribuer au partenariat pour le nuage européen pour la science ouverte (European Open Science Cloud, EOSC) d’Horizon Europe et à l’espace européen des données de santé (European Health Data Space, EHDS).

Comme le montre la figure ci-dessous, le projet s’appuie sur quatre grands piliers divisés en huit modules de travail : 

Sciensano contribue à plusieurs modules de travail présentés dans la figure ci-dessus :

  • MT2 — unité système européen d’information sur la santé (tâches relatives aux données cliniques et sanitaires)
  • MT4 — unité système européen d’information sur la santé (élaboration d’une boite à outils relative aux maladies infectieuses)
  • MT5 — unité santé publique et génome (responsable du MT ; cas d’utilisation)
  • MT6 — unité système européen d’information sur la santé (tâches relatives à la formation et à la mobilisation)
  • MT7 — centre sur le cancer (tâches relatives à la mobilisation des citoyens)
  • MT8 — unité santé publique et génome et système européen d’information sur la santé (mise en œuvre de l’approche ELSI et processus décisionnel)

List of partners

BBMRI-ERIC 

Barcelona Supercomputing Center (BSC)

CESSDA 

DANS — Dutch national centre of expertise and repository for research data

DTU — Technical University of Denmark 

EATRIS

ECRIN

ELIXIR

EMBL-EBI

EGA — European Genome-phenome Archive 

EMPIRICA

ERINHA 

MIRRI / MIRRI-IT

EU-OPENSCREEN ERIC

Euro-BioImaging  

University of Oxford

Fraunhofer

Gesundheit österreich

Greek review of social research (ΕΘΝΙΚΟ ΚΕΝΤΡΟ ΚΟΙΝΩΝΙΚΩΝ ΕΡΕΥΝΩΝ)

INFRAFRONTIER 

INSTRUCT-ERIC

Lygature

Masarykova Univerzita 

PHIRI (Population Health Information research infrastructure for COVID-19)

SIB Swiss Institute of Bioinformatics

ISAS CR (Institute of Sociology of the Academy of Sciences of the Czech Republic Public Research Institution), Czech Social Sciences Data Archive (CSDA)

Tampere University, Finnish Social Science Data Archive

THL — Finnish institute for health and welfare

University of Freiburg

University of Tartu 

Univerzita Palackého

University Medical Center Groningen 

SciLifeLab Data Centre 

VIB

CIRMMP

IACS — Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud

HSM Ospedale Policlinico San Martino 

IZSVe — Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie

IZSLER-Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia ed Emilia Romagna 

CNB — CSIC

ELIXIR Belgium

University of Ljubljana, Social Science Data Archives (ADP

eScience Lab, The University of Manchester

Office for Open Research @ UNIMAN 

 

Pour plus d’informations, rendez-vous sur : https://by-covid.org/ 
 

Partenaires

Source de financement

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