Centre National de Référence (CNR) des Pathogènes respiratoires
Pathogènes respiratoires : adenovirus, coronavirus dont SARS, human parainfluenza virus, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, respiratory syncytial virus (RSV), human metapneumovirus (HMPV) et Influenza virus
Communiqués importants
Augmentation des cas de Mycoplasma pneumoniae
La bactérie Mycoplasma pneumoniae est en augmentation en Belgique ainsi qu’en Europe et en Asie [1]. Les infections sont principalement rapportées dans la tranche d’âge de 5 à 20 ans. Des infections plus invasives causées par Mycoplasma pneumoniae sont également rapportées.
Vu le nombre croissant d’infections par Mycoplasma pneumoniae, le Centre National de Référence (CNR) pour les agents pathogènes respiratoires souhaite suivre cette évolution de près. Le CNR procède également à la détection de la résistance aux macrolides chez Mycoplasma pneumoniae. Nous vous demandons donc instamment de nous envoyer des échantillons positifs afin que nous puissions procéder à un typage plus poussé de Mycoplasma pneumoniae dans un intérêt épidémiologique, ainsi qu’à la détection de la résistance aux macrolides si cela s’avère nécessaire sur le plan clinique.
[1] P. M. Meyer Sauteur en M. L. Beeton of European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) Study Group for Mycoplasma and Chlamydia Infections (ESGMAC), and the ESGMAC Mycoplasma pneumoniae Surveillance (MAPS) study group „Mycoplasma pneumoniae: delayed re-emergence after COVID-19 pandemic restrictions,” The Lancet Microbe, 23 11 2023.
Informations générales
Veuillez consulter le site suivant si vous souhaitez plus d’informations sur les rapports hebdomadaires de la surveillance génomique du SARS-CoV-2: https://www.uzleuven.be/nl/laboratoriumgeneeskunde/genomic-surveillance-sars-cov-2-belgium
Veuillez consulter le site suivant si vous souhaitez plus d’informations sur la détection hebdomadaire en temps quasi réel des agents pathogènes respiratoires à UZ Leuven: https://www.uzleuven.be/nl/laboratoriumgeneeskunde/wekelijkse-detectieresultaten-respiratoirepathogenen
Hépatite — Epidémie d’hépatite chez les enfants en Europe (mai 2022)
- accompagné du formulaire de demande spécifique (voir menu au gauche) ;
- Voir aussi le bulletin d’information du CNR sur l’hépatite : bulletin d’information mai 2022(link is external).
Workflow
- Les échantillons remplissant les critères de définition sont envoyés au CNR pour les virus des hépatites (Sciensano) par voie normale accompagnés du formulaire de demande ad hoc dûment complété.
- Sciensano envoie les échantillons au CNR pour les maladies respiratoires (UZ Leuven) pour que soit effectuée une PCR Adenovirus.
- En cas de résultat positif, le CNR pour les maladies respiratoires (UZ Leuven) effectue le typage.
- En cas de résultat négatif, le CNR pour les maladies respiratoires (UZ Leuven) effectue une analyse métagénomique sur l’échantillon.
- L’excédent d’échantillon est conservé au CNR pour les virus des hépatites (Sciensano) dans le cas où des analyses complémentaires devraient être effectuées.
- Une fois les résultats connus, le CNR pour les virus des hépatites (Sciensano) se charge du rapportage aux clients.
Tests executés
- qPCR Pan-Adenovirus qPCR (UZ Leuven)
- Typage Adenovirus (UZ Leuven)
- Métagénomique Illumina (UZ Leuven)
Mis à jour août 2022
Bien que la cause de ces hépatites infantiles n’ait pas encore été déterminée avec certitude, une infection par un Adenovirus semble en être un facteur ou un cofacteur (https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2022.27.31.2200483(link is external)). Une publication récente (https://doi.org/10.110½022.07.19.22277425(link is external)) évoque une infection par Adeno-associated virus 2 (AAV2) comme étant une hypothèse étiologique.
Le virus est détectable dans le plasma. Par conséquent, nous vous saurions gré de prélever du sang total et de nous faire parvenir le plasma. Nous considérons toutefois important de continuer les investigations dans d’autres matrices et nous vous invitons à continuer à nous envoyer des selles par exemple lorsque c’est possible.
COVID-19
En décembre 2019, une épidémie de la maladie COVID-19, provoqué par un nouveau coronavirus (SARS-CoV-2) a éclaté à Wuhan, en Chine. Veuillez trouver la dernière mise à jour de la situation épidémiologique pour des informations épidémiologiques actuelles.
Qui doit être testé pour le COVID-19 ?
- Veuillez trouver la definition complète de cas et les procédures pour les médecins sur le site web de Sciensano: Définition de cas et les procédures COVID-19
Comment organiser le test de diagnostic?
- Il est obligatoire de remplir le formulaire électronique de HealthData (pour les médecins généralistes) et d’en envoyer une copie imprimée avec l’échantillon. Dans les hôpitaux, les mêmes données doivent être collectées et envoyées via le système que l’hôpital met à disposition.
- Les diagnostics sont effectués par des laboratoires médicaux locaux (liste des laboratoires disponible sur le site de Sciensano) ou par le Centre National de Référence pour les agents pathogènes respiratoires (site : UZ Leuven). Les centres de triage ou les collectivités peuvent travailler avec la plate-forme fédérale du testing.
- Si vous avez des questions concernant le résultat d’un test COVID-19 effectué par le CNR, veuillez contacter le CNR aux numéros de téléphone suivants : 016/34.62.19 ou au 016/34.64.40.
Pour l’emballage d’échantillon de COVID-19, voir le site web de Sciensano, ›COVID19_procedure_sampling›:
Le prélèvement doit être :
- dans un tube UTM, dans
- un sachet plastique hermétiquement refermable avec un papier absorbant, dans
- une enveloppe matelassée.
Veuillez ajouter le formulaire de demande dans un deuxième sachet plastique, et attacher le tout à l’extérieur de l’enveloppe matelassée.
Liens utiles
Les slides de la session d’information (26/10/2023) concernant les activités du CNR Pathogènes Respiratoires peuvent être consultées via: Session d’information octobre 2023