Centre National de Référence (CNR) pour les E. coli producteurs de Shiga-toxines (STEC)

Communication importante (à partir du 01.01.2025)

La caractérisation épidémiologique des STEC par WGS

Vu l’augmentation du nombre d’échantillons positifs à STEC, le CNR effectuera la caractérisation des souches STEC par WGS uniquement sur une sélection de souches à partir du 01.01.2025.

Les souches suivantes seront caractérisées par WGS :

  • Souches STEC positives pour stx2 (sauf stx2f)
  • Souches STEC provenant de cas de SHU
  • Souches STEC provenant d’une épidémie
  • Souches STEC de sérotypes O26 et O157

Remarque: le WGS peut être réalisé sur demande pour des critères différents de ceux mentionnés ci-dessus. Veuillez contacter le CNR à ce sujet.

Communication importante pour la classification du risque des STEC

Les souches possédant le gène stx2f semblent moins pathogènes. A partir du 01.01.2025, les souches stx2f-positives seront rapportées comme étant à bas risque. Veuillez consulter la section ‘Typage systématique des STEC et classification du risque’ pour plus d’informations.

Considérations générales concernant le diagnostic des infections à STEC

Les E. coli producteurs de Shiga-toxines (STEC) sont une cause importante d’infections gastro-intestinales dans le monde entier. L’infection à STEC cause en général une diarrhée modérée à sanglante, mais évolue parfois vers le syndrome hémolyse-urémie (SHU) qui peut menacer le pronostic vital.

Le diagnostic des infections STEC revêt une importance particulière pour la détection rapide des épidémies. L’INAMI prévoit un remboursement pour la recherche du sérotype de STEC le plus fréquent, O157:H7/H-, sous certaines conditions. Les activités du CNR ne se limitent pas seulement à détection de ce sérotype.

Pour une détection précoce des épidémies, il est important d’envoyer des échantillons de selles au laboratoire de référence pour chaque cas de syndrome hémolytique urémique, même si O157 est détecté localement (des infections mixtes sont également possibles). Ces cas représentent «la partie émergée de l’iceberg » dans la surveillance et la détection précoce des épidémies, qui peuvent conduire à l’identification et l’élimination d’une source d’infection.

Note concernant la dénomination de ces micro-organismes:

Pendant des années, le CNR a préféré utiliser la dénomination “vérocytotoxine” pour la toxine et “ E. coli entérohemorrhagique ” pour le  micro-organisme qui la produit. Bien que ces dénominations restent acceptées, on voit que la littérature se limite de plus en plus à l’utilisation de “Shiga toxine” et “ E. coli producteur de Shiga-toxines (STEC)”, qui seront utilisées dorénavant par le CNR.

Liens utiles:

Ci-dessous, vous trouverez les rapports du CNR.

Vous pouvez consulter les rapports de surveillance épidémiologique qui les accompagnent via: Sujet de santé E. coli pathogènes

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