Beschrijving van de test
Identificatie (eerste stap)
Na de kweek op een agarbodem wordt een MALDI-TOF massaspectrometrieanalyse uitgevoerd. Het resultaat van deze eerste analyse wordt onmiddellijk gerapporteerd. Afhankelijk van de aard van het micro-organisme is dit een identificatie tot op genus-, complex- of soortniveau. Zo worden bvb. Achromobacter spp. gerapporteerd op genusniveau, terwijl Stenotrophomonas maltophilia gerapporteerd wordt op soortniveau. Leden van het Burkholderia cepacia-complex, met uitzondering van B. multivorans, kunnen niet op betrouwbare wijze onderscheiden worden en worden als complex gerapporteerd.
RAPD DNA-typering
Stammen worden getypeerd met behulp van de RAPD-techniek om snel te kunnen beoordelen of er overeenkomsten bestaan met eerdere isolaten van dezelfde soort van dezelfde patiënt.
Antibioticagevoeligheidstesten
De gevoeligheid van het isolaat voor bruikbare antibiotica wordt bepaald via microdilutietesten voor de volgende antibiotica: temocilline, piperacilline, piperacilline/tazobactam, aztreonam, ceftazidime, ceftazidime/avibactam, ceftolozaan/tazobactam, cefiderocol, meropenem, ciprofloxacine, levofloxacine, tobramycine, amikacine, tigecycline, eravacycline, trimethoprim/sulfamethoxazol en colistine.
Omdat EUCAST geen kritische concentraties voor de Burkholderia cepacia-groep oplevert, werden de concentraties in de PK/PD-tabel van Pseudomonas spp. voor CLSI gebruikt om een gekwalificeerde interpretatie te geven. Antibiotica waartegen een natuurlijke resistentie vertoond wordt, worden altijd als resistent gerapporteerd (bvb.: colistine voor B. gladioli)
Doel van de test
Criteria om deze test uit te voeren als onderdeel van de referentieactiviteiten
- Patiënten met mucoviscidose: laboratoria worden gevraagd om twee respiratoire isolaten per patiënt per jaar en per bacteriesoort naar het NRC te verwijzen.
- Andere patiënten: alleen met een goed gedocumenteerde motivatie (uitbraak, specifieke klinische presentatie, enz.).
Staalname
Transport
Onaanvaardbare aanvragen
- Isolaten zonder klinische relevantie
- Isolaten van Pseudomonas aeruginosa of Acinetobacter spp.
- Omgevingsisolaten (tenzij er een speciale overeenkomst is voor uitezonderlijke omstandigheden, zoals bij het bestuderen van een uitbraak).
- Isolaten die niet vergezeld gaan van een ingevuld formulier.
- Meer dan twee isolaten per soort en per patiënt per kalenderjaar
Turnaround time.
- Voorlopige identificatie: 2 werkdagen. Een eerste MALDI-TOF MS-analyse is doorgaans mogelijk na incubatie overnacht. Het resultaat wordt dan de dag na ontvangst van de stam bekendgemaakt.
- Antibioticagevoeligheid: 5 dagen
- RAPD: 14 dagen
Rapportering van testresultaten
- Via de post
- Via Medibridge voor de laboratoria en voorschrijvers die een aansluiting met het UZ Brussel hebben