Beschrijving van de test
In een tweede stap worden de isolaten nader bestudeerd door LM-UGent.
Moleculaire bevestiging van identificatie
LM-UGent gebruikt sequentieanalyse van het recA-gen om Burkholderia cepacia-complex isolaten accuraat op soortniveau te identificeren.
Multilocus-sequentieanalyse (MLST)
- Alle Burkholderia-soorten. Isolaten van mucoviscidosepatiënten worden getypeerd met behulp van de MLST-methode, geëxtraheerd uit volledige genoomsequenties.
- Isolaten van andere patiënten worden alleen met MLST getypeerd als er een specifieke indicatie is.
Doel van de test
Het verband tussen een ongunstige klinische ontwikkeling van de longfunctie bij mucoviscidosepatiënten en de aanwezigheid van bepaalde micro-organismen in luchtwegsecreties is nog steeds onvoldoende gedocumenteerd. Een ‘cepaciasyndroom’ met snelle verslechtering en soms een kortdurende fatale afloop is in verband gebracht met een B. cenocepacia-infectie. Het is echter onduidelijk of alle stammen van deze soort of alleen een subgroep verantwoordelijk zijn voor dit ongunstige klinische beeld, en of andere soorten van deze groep eveneens een verhoogde virulentie vertonen.
Criteria om deze test uit te voeren als onderdeel van de referentieactiviteiten
- Patiënten met mucoviscidose: deze testen worden systematisch eenmaal per jaar per patiënt uitgevoerd, tenzij de RAPD aantoont dat er een nieuwe stam is ontstaan.
- Andere patiënten: deze testen worden alleen uitgevoerd voor speciale gevallen en taxonomische studies
Staalname
Exemplaren
Geen aanvraag (zie hierboven)
Transport
Geen aanvraag (zie hierboven)
Onaanvaardbare aanvragen
Indicaties
Geen aanvraag (zie hierboven)
Voorbeelden
Geen aanvraag (zie hierboven)
Turnaround time
- Moleculaire bevestiging van identificatie: maximaal 17 dagen
- Multilocus sequentieanalyse (MLST): maximaal 90 dagen.
Rapportering van testresultaten
De resultaten worden door UZ Brussel meegedeeld. (zie hierboven)