Beschrijving van de test
Isolaten worden geïdentificeerd door MALDI-TOF MS. Niet alle Legionella species worden met dit systeem geïdentificeerd vermits de Bruker database nog niet volledig is met alle referentie spectra. Indien identificatie met MALDI-TOF-MS niet mogelijk is, kan indien noodzakelijk mip gen sequencing gebruikt worden voor identificatie.
De subtypering van serogroep 1 en de typering van seroepen 2-15 dmv IFA met monoclonale antilichamen worden uitgevoerd voor de differentiatie van bijzondere isolaten in geval van hoge aantal isolaten, met de bedoeling om het aantal te typeren isolaten met de dure genetische sequenering te reduceren.
De Sequence based typering (SBT) wordt voor stamen van serogroep 1 uitgevoerd, maar is ook mogelijk voor de andere serogroepen. De SBT wordt ook rechtstreeks op respiratoires stalen uitgevoerd wanneer de PCR is positief maar de kweek negatief blijft. Er moet wel opgemerkt dat de rechtstreekse SBT is minder gevoelig en een volledige allelische profiel wordt niet altijd bekomen.
Voor de meest frequente SBT types kan de Whole genome sequencing (cgMLST ou wgMLST) worden uitgevoerd voor een verdere differentieatie van de stammen.
We gebruiken een latex agglutinatietest voor serotypering en confirmatie van identificatie van klinische en omgevings isolaten. Deze latex agglutinatietest laat aparte identificatie van L. pneumophila serogroep 1, serogroepen 2-15 en vaak geïsoleerd legionella species toe.
Doel van de test
Bevestiging van de diagnose en uitbraak onderzoek.
Criteria voor het uitvoeren van deze test in het kader van de referentie activiteiten.
- Alle humane isolaten worden geaccepteerd. We gebruiken de stammen (of de klinische stalen indien geen isolaten beschikbaar zijn) voor het epidemiologisch onderzoek bij een uitbraak.
- Stammen geïsoleerd uit de omgeving als onderdeel van een onderzoek bij uitbraak. Buiten de epidemiologische onderzoeken rond één of meerdere gevallen wordt de test gefactureerd
Instructies voor het staal
- Reinculturen op BCYE (buffered charcoal yeast-extact) medium
- Bewaarcondities: 2-5°C
Instructies voor het transport
- Transportcondities: kamertemperatuur (< 1 dag)
- Op aanvraag van het verwijzend laboratorium kan speciaal transport medium voor Legionella worden verstrekt.
Onaanvaardbare aanvraag
/
Turn around time (en de frequentie van analyse)
Tests worden niet uitgevoerd tijdens het weekend.
Identificatie en serotypering: mediaan: 1 week. Maximaal: 14 dagen.
SBT (sequence based typing) typering: 15 werkdagen (in geval van uitbraak en/of als vergelijking met omgevings stammen mogelijk is).
Rapportering van de testresultaten
- Per beveiligde email en post: in geval van positief resultaat
- Per post: in geval van een negatief resultaat