De volledige genoomsequentie voor de diagnose van ziekteverwekkers bij Sciensano: een toekomstvisie

Gepubliceerd op: 
vrijdag, 29 maart 2019
Last updated on 6-9-2022 by Cassandre Dugailliez

Next Generation Sequencing of NGS heeft als niet verwaarloosbaar voordeel dat zij de routinematige surveillance van verschillende ziekteverwekkers van microbiële oorsprong, zoals tuberculose, in grote mate verbetert. Deze geavanceerde technologie maakt het immers mogelijk om de resultaten bekomen met klassieke analysemethoden te overtreffen.

Sciensano heeft de methode van de volledige genoomsequentie op de bacterie Neisseria meningitidis toegepast. De methode en haar validatieproces hebben het voorwerp uitgemaakt van een PDF-pictogram publicatie in het vakblad Frontiers in Microbiology (Impact Factor 4.076), wereldwijd het op twee na meest geciteerde vakblad voor microbiologische onderwerpen.

Een complexe methode met tal van mogelijkheden

Een volledige genoomsequentie is niet eenvoudig uit te voeren en vereist een aantal noodzakelijke stappen met het oog op een routinematig gebruik. Om te beginnen, dient men over de nodige middelen te beschikken. In dat opzicht heeft Sciensano massaal geïnvesteerd in de laboratoriumapparatuur, IT-infrastructuur en expertise die nodig zijn voor het beheer, de analyse en de interpretatie van de gegevensstromen die door de geavanceerde technologie worden gegenereerd. In navolging van de andere laboratoria met een kwaliteitssysteem, heeft Sciensano moeten aantonen dat de gebruikte methode wel degelijk in overeenstemming is met de doelstelling, fit-for-purpose (conform het gestelde doel), en dat zij het mogelijk maakt om de verwachte kwalitatief hoogstaande resultaten te bekomen.

Door zich te buigen over de bacterie Neisseria meningitidis heeft Sciensano de weg vrijgemaakt voor nieuwe veelbelovende perspectieven op het vlak van onderzoek en tezelfdertijd zijn knowhow inzake volledige genoomsequenties kunnen aantonen.

De voordelen voor de volksgezondheid

Sciensano is er trots op het bewijs te hebben geleverd dat zijn geavanceerde analyse- en laboratoriumtechnieken succesvol hebben kunnen integreren, en die in de toekomst mogelijk voor andersoortige bacteriologische surveillances kunnen worden toegepast. Met de validatiestrategie ontwikkeld door Sciensano hebben we kunnen aantonen dat de methode erg accuraat is, zowel voor de intern verkregen gegevensstromen als voor de gegevensstromen die tot het publiek domein behoren. Deze validatiestrategie toont ook aan dat de gegenereerde bio-informaticastromen in een kwaliteitssysteem kunnen worden geïntegreerd en dat de volledige genoomsequentie een alternatief biedt voor de conventionele analysemethoden, zelfs voor de kleinere laboratoria.

QR code

QR code for this page URL